大河内癒しの森遊歩道の大部分は、九州大学宮崎演習林の保護林内にあり、勝手に歩くことはできません。遊歩道を歩くには、大学認定のインストラクターが同行しなければなりません。インストラクター（有料）の手配は「大河内森林ガイドの会（TEL/FAX 0983-38-1440）」までお問い合わせください。
１．槙鼻コース【全行程4時間】
すべて自然林で、森林と渓流が美しいコース。春のアケボノツツジ、夏の澄んだ沢、秋の紅葉が魅力。3つの滝が流れ落ちる銀鏡谷（しろみだに）は一見の価値がある。1時間40分のショートコースもある。
２．御神滝コース【全行程40分】
橋の下から落差30mの滝が落ちる。広い滝つぼと、驚くほどの水量に感動する、天然のマイナスイオンの場。
３．矢立コース【全行程4時間】
ハーフコース（全行程2時間30分）も設定している。自然林と人工林が交互に現れるゆったりコース。市房山を間近に見ながら、苔むした岩やキツネノエリマキ群落、鹿や山鳥に癒される。冬の積雪やツララを楽しむこともできる。
４．男蛇淵コース【全行程15分】
大蛇伝説がある滝。広く深い滝つぼに大岩が点在する流れは、神秘的なたたずまい。
５．九大演習林展望所コース【全行程30時間】
深い自然林を高台から見晴るかすコース。自然林の全体像が手に取るようにわかる。
６．江代山登山コース【全行程5時間】
これまで立入禁止であった山ですが、大学の特別な計らいにより、インストラクター同行のもとで登山が許可されます。岩屋谷から山頂へのぼり、センツキ谷へと下山する魅力的な周回コース。
７．三方岳登山コース【全行程5時間】
九州百名山に数えられる人気の山です。ガイドブック掲載の、唯一開放されているルートをたどります。ガイドブックで受ける印象よりはずっとハードなアップダウンの山です。夏場は熱中症に相当の用心が必要。携帯電話も通じないので、無線を持ったちゃんとしたガイドの同行がベストです。